Verksamhetsområdet strategisk verksamhetsplanering har ansvarsområden inom verksamhetsplanering, verksamhetsuppföljning och ekonomisk redovisning. Följande enheter ingår i verksamhetsområdet:
Ledningskansliet
Enheten bereder dagordningar till styrelse- och ledningsgruppsmöten, kvalitetssäkrar remisser och regeringsuppdrag, ansvarar för verksamhetsplan, samordnar och redigerar årsredovisning och miljöredovisning, utreder/projektleder verksövergripande projekt och fungerar som stöd till ledningsgruppen för Läkemedelsverket.
Ekonomienheten
Enheten har ansvaret att samordna utvecklingen av ekonomiområdet så att det stödjer verksamheten på bästa sätt. Övergripande uppgifter är att ansvara för löpande redovisning, ekonomisystem och ekonomisk statistik samt att aktivt leda utvecklingen av budgetarbete, prognosarbete, kalkylering, nyckeltal, prestationsmått och månadsuppföljningar. Finansiellt bokslut och inrapportering till statsredovisningen ingår också i ansvaret, liksom att samordna arbetet gällande ändringar i Läkemedelsverkets avgiftsnivåer.